山西醫(yī)科大學前身是山西醫(yī)學傳習所,創(chuàng)建于1919年8月。1921年8月,改為山西醫(yī)學專門學校。1928年8月,更名為山西醫(yī)學??茖W校。1932年1月,組建為私立山西川至醫(yī)學專科學校。1940年3月并入山西大學,稱作山西大學醫(yī)學專修科。1946年8月,升格為國立山西大學醫(yī)學院。1953年9月,獨立建校,更名為山西醫(yī)學院。
1996年9月,更名為山西醫(yī)科大學。學校是全國第三批、山西省首批博士學位授權(quán)單位,全國首批碩士學位授權(quán)單位,全國首批學士學位授權(quán)單位,教育部首批“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃”試點單位,全國開辦七年制臨床醫(yī)學專業(yè)的25所醫(yī)學院校之一,全國首批恢復兒科學本科專業(yè)的8所醫(yī)學院校之一,國家中西部高校基礎(chǔ)能力建設(shè)工程支持高校。